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FlowSOMは、Self-organizing map（SOM)を構築し、すべての細胞のマーカー発現を俯瞰し、マニュアルゲーティングでは見落とされてしまう可能性のある細胞サブセットを明らかにするパワフルなクラスタリングアルゴリズムです¹。この解析法は、シングルセル解析ワークフローの多くのポイントに導入することができ、マニュアルゲーティングの前や後に用いるだけでなく、その代わりとして使用することも可能です。FlowSOMは、結果が迅速に得られることに加えて、細胞クラスターを自動的に高次のメタクラスターへとグループ化することができます。この動画では、Cytobankプラットフォーム上でFlowSOMを実行する理由と方法、そして結果をどのように解釈すれば良いか説明しています。

詳細や手順をさらに知りたい方は、 Cytobankのサポートページもご覧ください。

参照文献

1. Van Gassen S, Callebaut B, Van Helden MJ, et al. FlowSOM: Using self-organizing maps for visualization and interpretation of cytometry data: FlowSOM. Cytometry. 2015;87(7):636-645. doi:10.1002/cyto.a.22625