次世代シークエンサーサンプルのサイズセレクションを
より高品質に、よりハイスループットに

次世代シークエンス解析は、現在のゲノミクス研究において急速に普及しています。そのサンプル調製に必要なDNA 断片のサイズセレクションは、得られるシークエンス結果に大きな影響を与えます。 Solid Phase Reversible Immobilization(SPRI)テクノロジーを採用したSPRIselectキットを用いることにより、DNA サイズセレクションを高い再現性とスループットで行うことが可能です。

Agencourt SPRIselect

特長

  • 150bp ~800bpの任意の範囲でサイズセレクションが可能
  • SPRIselectとマグネットツールのみで、ゲルや特別な装置は一切不要
  • 厳しい品質管理により、高い再現性を実現

SPRIselectキットは、磁気ビーズによるDNAサイズセレクション用試薬です。SPRIテクノロジーを用いた磁気ビーズは、バッファー濃度によって結合する核酸サイズが異なります。

この特徴を利用することにより、SPRIselectとサンプルとの混合比率を変更するだけで、異なる長さの核酸を任意に選択することが可能です。選択可能なDNAサイズは150bp ~ 800bpで、多くの次世代シークエンサーの目的サイズにフィットします。

また、ピペッティング操作のみで処理できるため、処理サンプル数の増加や、自動分注機による自動化にも対応可能です。

SPRIselectキットは、高分子領域の回収(レフトサイドサイズセレクション:図A)、低分子領域の回収(ライトサイドセレクション:図B)、中間領域の回収(ダブルサイドサイズセレクション:図C)の3つのプロトコールに対応しています。DNA溶液とSPRIselect試薬を混合すると、磁気ビーズに高分子領域のDNAが吸着し、溶液中に低分子領域のDNAが残留します。

また、サンプルに対するSPRIselect試薬の混合比率を大きくすることによって、より低分子のDNAがSPRIビーズに吸着されます。

これらを組み合わせることにより任意の範囲のDNAを回収することが可能です。














図A レフトサイドサイズセレクション
図B ライトサイドサイズセレクション
図C ダブルサイドサイズセレクション

大量処理も可能な効率の良いプロセス

SPRIselectは磁性ビーズによるサイズセレクションのため、96ウェルベースでの大量処理にも適しています。
ベックマン・コールターの自動分注機Biomekシリーズによる自動化も可能です。Biomek FXPを用いれば、96サンプルのダブルサイズセレクションを、約1時間50分で処理可能です。
BiomekによるSPRIselectの自動化の詳細
またBiomekを用いることにより、ライブラリー調製などサイズセレクション以外の次世代シーケンサーの前処理ステップも自動化可能です。
Biomekによる次世代シーケンサー前処理の自動化の詳細

実験ステップ

レフトサイドサイズセレクション プロトコール

x R1のレフトサイドサイズセレクションの場合

  • 1:  (サンプル量 x R1) のSPRIselect Reagentをサンプルに添加
  • 2:  10回ピペッティングし1分静置、または1分ボルテックス
  • 3:  SPRIビーズをマグネットで分離し、上清を除く
  • 4:  85%エタノールで洗浄
  • 5:  溶出溶液を加え、攪拌
  • 6:  SPRIビーズをマグネットで分離し、溶出液を回収
ライトサイドセレクション/ダブルサイドサイズセレクション プロトコール

x R1 - x R2のサイズセレクションの場合(R1 > R2)(ライトサイドサイズセレクションの場合R1=1.8)

  • 1:  (サンプル量 x R2) のSPRIselect Reagentをサンプルに添加
  • 2:  10回ピペッティングし1分静置、または1分ボルテックス
  • 3:  SPRIビーズをマグネットで分離
  • 4:  上清を別の容器に回収
  • 5:  回収した上清に(開始時のサンプル量 x (R1 - R2)) のSPRIselect Reagentをサンプルに添加し、攪拌
  • 6:  SPRIビーズをマグネットで分離し、上清を除く
  • 7:  85%エタノールで洗浄
  • 8:  溶出溶液を加え、攪拌
  • 9:  SPRIビーズをマグネットで分離し、溶出液を回収

仕様

内容構成

  • SPRIselect Reagent

マニュアル・SDSなど

アプリケーションノート

Order Information

製品名 サイズ 製品番号 価格(税別)
SPRIselect 5 mL B23317 ¥38,000
60 mL B23318 ¥148,000
450 mL B23319 ¥680,000

マグネットアクセサリ

使用時に必要です。

関連情報